新生儿肝脏的解毒功能较差，且肾脏的排泄功能较低，所以选用药物、剂量均应考虑到这些特点。下列这些药物由于对新生儿会造成各种危害，一般不用或慎用。
1、链霉素：
因为它能损害小儿的听神经，影响小儿的听觉，有时甚至可造成链霉素性耳聋，较难恢复。链霉素对肾脏也有损害，故最好不用。
2、四环素族药物：
该类药物易沉积于骨组织，妨碍小儿骨骼发育。服用数月后可使牙齿变黄，即所谓的“四环素牙”。
3、卡那霉素、庆大霉素也能损害听神经，且对肾功能有影响，应用时间不宜过长，一般不超过10天。
4、维生素K3、K4、磺胺类药物等可引起新生儿黄疸。
5、氯霉素可抑制骨髓，并发灰白综合症。
孕妇用药也可通过胎盘进入胎儿体内；哺乳期母亲用药也可通过乳汁传给婴儿，故也应慎用。
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